霉菌一般指真菌，潮湿温暖久未打扫的环境中，霉菌繁殖较多。因为健康人肺部有免疫防御功能健全，如果吸入霉菌后，无明显症状，不需要吃什么药。
真菌种类繁多，根据病原菌的致病力可分为致病性真菌（如组织胞浆菌病、芽孢杆菌病、球孢子菌病）和机会致病性真菌（如曲霉病、念珠菌病、毛霉菌病）。人吸入霉菌后，可得肺真菌病。如果吸入者有发热、咳嗽咳痰、胸痛和肌肉疼痛等症状，应引起重视。但是除非免疫系统通常由于免疫抑制药物或疾病造成免疫力缺陷，否则真菌感染很少造成严重的后果。所以不同人肺部感染真菌后，有的症状很轻微，有的很严重。
目前已经有了很多不同种的抗真菌的药物，如两性霉素B可以针对大多数的真菌感染；阿尼芬净、卡泊芬净和米卡芬净主要针对曲霉菌和念珠菌感染；氟康唑和氟胞嘧啶针对念珠菌和隐球菌感染，氟康唑还可针对球孢子菌病；异氟康唑针对曲霉病和毛霉菌病感染。真菌的结构使其难以短时间被清除，所以抗真菌的治疗常要几个月的时间。此外，抗真菌的药物比抗生素副作用要大，有必要监测肝肾功能。
不同的病情和真菌类型，需要用不同的治疗方案。有时引发变应性反应（如过敏性支气管肺曲霉病），还要加上抗过敏治疗。肺部真菌感染的诊断和治疗都需要谨慎，请就医后遵医嘱用药。